年后，至公元前四十五年，“托勒密河道”淤塞废弃。
公元九十八年，罗马皇帝图拉真开凿了一条新河道，起自巴布里尤——即开罗，止于阿拔萨，与通往苦湖的古河道衔接。
到了拜占庭时期的公元四百年，“图拉真河道”淤塞，无法通航。
公元六四二年，阿拉伯帝国大将阿慕尔?伊本?阿绥重疏“图拉真河道”，起符斯塔特——即开罗，迄古勒祖姆——即苏伊士。
公元七六七年，阿拔斯王朝哈里发艾布?加法尔?曼苏尔为封锁反对他的麦加、麦地那人，下令填平运河下游。
自此，“法老运河”彻底废弃。
“法老运河”废弃后，东西方贸易的路线，就变成了“水陆联运”——走地中海水路至亚历山大，接埃及陆路至古勒祖姆——即苏伊士，再经红海、印度洋水路至印度。
大致同是次阿礼国回任以及法国陆军进军路线相仿佛。
十三世纪，威尼斯共和国利用十字军远征东方的便利，另辟一条商路：从威尼斯越地中海至大马士革，再经叙利亚、波斯陆路到印度。
公元一四五三年，奥斯曼土耳其攻占君士坦丁堡，上述两条路线中的陆路部分，皆被切断。
公元一四九八年，葡萄牙水手瓦斯科?达?伽马从大西洋沿非洲西海岸南行，开辟了绕好望角进入印度洋、太平洋的新航道。
这条航道迅速成为欧洲各国东向的主航道，数百年间，没有人再去想着恢复“法老运河”了。
直到拿破仑一世占领埃及。
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