此时的御坂美琴那边确实是遭遇到了前所未有的大危机。和林顿分开之后，她自然是继续跟着御坂妹妹，准备跟着她回研究所，找到这个克隆计划的幕后黑手。然而一直跟到晚上，御坂美琴才知道对方根本没有回研究所的打算。
御坂妹妹表示自己要去参加实验，至于是什么试验，这是秘密事项。这样一来跟着她好像也没什么用，毕竟御坂美琴要找的是幕后黑手，但是对方不准备回去。于是御坂美琴准备回去先用电脑查查资料，最好能找到什么目标，直接去找这个邪恶科学家本人。
之前御坂美琴就已经委托她的朋友初春饰利开始尝试破解御坂妹妹报出的那些密码了，经过一番努力，御坂美琴终于收到了破解后的信息。信息指向了一份文件，被称为“绝对能力者进化计划”的文件。
通过手持PDA，御坂美琴看到了这份计划的情况，然而稍微的读了一下，御坂美琴冷汗直流。这份计划远远的超出她的想象范围，原本以为对方制造自己的克隆人是为了替代自己或者别的什么奇怪的目的，然而事实情况是，这些克隆人御坂，都只是这份计划中的“实验动物”。
绝对能力者进化计划是一份针对现在学园都市中LEVEL5排名第一的叫做一方通行的人所以特别制定的计划，目的是为了让他突破LEVEL5的限制，成为绝对能力者LEVEL6，甚至突破人类的限制。
为了达到这个目的，人工智能树形图设计者计算的结果，需要在不同的场合击杀排名第三的LEVEL5，也就是她自己御坂美琴共计128次。然而这显然是不可能做到的，人被杀就会死，一次就没命了，当然不可能进行128次。
所以克隆人试验孕育而生，然而问题是制造出来的克隆人御坂妹妹并没有LEVEL5的水平，大部分都是LEVEL2-LEVEL3之间而已，所以经过树形图设计者再次计算，大概需要重复2万次才有可能完成这个试验。也就是说，目前的情况就是，学院制作了2万个御坂美琴的克隆人，然后准备把她们都交给这个叫做一方通行的人杀死，让对方进化。
看完这份资料，御坂美琴气得浑身发抖，大热天的全身冷汗手脚冰凉。这个世界还能不能好了，到底要怎么活着学院的高层才能才满意，眼泪不争气的流了下来。
“这是什么东西，怎么会有这种胡扯的计划。”御坂美琴一边说着，一边却开始担心刚刚分开不久的御坂妹妹了，虽然知道对方是克隆人，虽然才认识一天，但是御坂妹妹确实在御坂美
…。。