有澎湖的朱濆和彰化的陈周全吸引清廷的火力，周琅就可以放手进行商业开拓了。
往返台湾内地贩卖粮食，这从来都不是周琅的考虑，在印度的时候，制定的计划中，也没考虑过这种经营模式，开放港口，吸引商人前来贸易，收取水手收入，就足够了。
周琅的海船用来进行短途贸易，完全是一种浪费，他要做的是开辟远洋贸易。之前他需要舰队保护，现在港口有炮台拱卫，加上清军对周琅发动攻击的可能性大大降低，周琅可以抽出手下的舰队进行远航开拓了。
中国、印度之间的贸易，这是计划中的核心业务，因此周琅决定，派出两艘船，作为固定航班，往返中印之间。
另外依托台湾的地理位置，周琅决定开辟日本航线，打开跟日本之间的贸易。传统的南洋航线，周琅也可以尝试介入。
郑芝龙时代，每年跟日本之间的贸易，可以获得两百万两银子的利润，如果周琅可以将中日贸易利益开发到这种程度，那么就足以维持保持目前牌面的投入。如果传统的南洋航线也能获得相当的利益的话，周琅就有机会持续扩张。如果中印之间的贸易，能够开发到跟两国经济体量相匹配的程度，周琅就可以获得持续快速扩张的推动力。
中印贸易，特别派遣魏连理前往广州，让他跟十三行总商蔡世文建立联系，以取得充足的货物供应，主要商品目标就是热销的茶叶、丝绸和瓷器老三样。
南洋航线则由对这一地区十分熟悉的谢清高负责开发，筹备货物，跟当地华人势力进行贸易，甚至建立官方联系，这些都交由谢清高负责。
日本航线则缺乏门路，但这一点朱濆哪里可以解决。朱濆是纵横闽海数十年的大海商，他的家族时代做海贸，门路之广堪称这个时代第一人，远不是那些忽然崛起的海盗集团能够比拟的。就算朱家自己不走日本航线，朱濆也有认识的经营日本航线的朋友。托他的关系，带周琅去日本不是难事。接着周琅打算跟日本幕府建立外交关系，争取谋求到贸易优惠。必要的时候，可以打夷夏之辨的牌，借助日本和朝鲜这些周边民族对华夏的认同感，强调满清的夷人背景；或者可以打郑成功的牌，郑成功在日本，同样是一个英雄。什么手段都能用，做生意吗，不寒碜。
这三大开拓是重点，其他也可以兼顾，比如可以在航路途径之时，跟菲律宾的西班牙殖民当局，越南阮朝、西山朝等割据势力，跟中国保持着一定贸易往来的暹罗王国，缅甸等，都可以尝试建立外交和贸易关系。
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