也多亏了天色太黑和座船不够气派，没有过于引起吴军水师将士的注意，石达开的旗舰才侥幸没有遭到吴军水师的全力追杀，险之又险的在江宁镇附近靠上南岸，摆脱吴军水师的追击，没有稀里糊涂的变成水中冤魂。
然而其他大部分的太平军将士就没有石达开这么幸运了，高机动大吨位的吴军蒸汽炮船甚至不用开枪开炮，也用不着刻意去撞击敌船，直接用高速行驶带起的波浪就掀翻了数量众多的太平军运兵船，无数侥幸在运漕战场上逃生的太平军将士落入江水，挣扎呼救，随波沉伏，溺死呛死者不计其数，场面惨不忍睹。
再接着，吴军舢板船队也赶来参战劫杀，又将更多的太平军运兵船击沉烧毁，太平军将士的伤亡数字更是飞速上升，最后石达开好不容易在和州集结的七千多残兵败将活着逃到长江南岸的还不到两千人，包括得力谋士曾锦谦和大将曾广依、许桂和、徐林忠在内的众多文武官员惨死在渡江途中，能够跟着陈玉成逃到北岸的将士也不到千人，损失惨重得让无数太平军将士放声大哭，也让石达开眼泪流尽，咬牙出血。
再怎么痛哭也没用了，阵亡的嫡系将士已经不可能再活过来，又在岸上看到吴军船队密密麻麻的沿江而下，石达开马上就明白南京大战将要比自己估计的更早展开，所以在哭出血泪之后，石达开也没敢做任何的迟疑，赶紧带着仅剩的残余兵将疾行向东，急匆匆赶回南京来和洪秀全见面。
还好，因为南京太平军在江心州、永定州和大胜关都派驻得有军队守卫的缘故，必须要先拿下这些外围屏障的吴军冯三保并没有急着大举登陆，丢光了所有辎重武器的石达开军这才得以顺利逃进了南京外郭，跑到了南京城下请求入城觐见洪秀全。
被张遂谋和曹卧虎料中，穷急回京的石达开果然没再受到之前的隆重欢迎，翻脸不认人的洪秀全甚至不许石达开率军入城，先是逼着石达开的残余兵马在雨花台立营驻扎，然后才派人宣召石达开入城觐见，同时明确要求石达开只带不许超过十人的随从进城，石达开窝火万分，可是又无可奈何，只能是老老实实的奉诏行事，在蒙得恩总领的南京太平军将士监视下入城，灰头土脸的进到天王府拜见洪秀全。
事还没完，见到连遭惨败的石达开时，洪秀全不但没有半句好言安慰，相反还一见面就冲着石达开怒吼，直呼名字的咆哮，“石达开，你是干什么吃的？四万多天国大军，前后才四天来点时间，居然给朕丢得精光！你这个翼王八千岁到底会不会打仗？天国给你那么高的爵位，朕
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