梦中也有不友好的存在，但大多数宝可梦都不会主动攻击其他生物，宝可梦降临以后这个世界的原生动物确实生存空间大大减少，但宝可梦们并没有主动去攻击这些动物，反而对野生生物表现的非常友好。
而造成人类跟宝可梦战斗的原因也并不完全是宝可梦的错，起初人类也没有主动攻击宝可梦，但宝可梦展现的力量过于神奇，导致一部分人类开始觊觎这些力量，想要控制宝可梦，可手段用错了。
于是第一批降临的宝可梦对人类升起了警惕心，再加上人类暴力捕捉的手段，两边的战争就这样开始了。
后来的战斗就比较简单了，因为一开始人类和宝可梦已经敌对，导致后来降临的宝可梦在什么都不知道的情况下被人类攻击，然后开始反击，就这样，一场完全没有必要的战争打响。
千林接受系统选择科普宝可梦，不是因为他站在宝可梦那边，他也是人类，只是在他了解宝可梦真相之后，他想调停这场毫无意义的战争而已。
不奢求人类能完全接受宝可梦的存在，他只想告诉人类和宝可梦两方，这场战争没有任何意义，双方其实是可以和平共处的。
就这么简单。