《左传》有云：“国之大事，在祀与戎”。祀就是国家的各种祭祀典仪，戎指的是国家的军事行动。朱由校在两年内发动了对建虏和西南土司的三场大仗，虽然耗费了巨额的财政，致使国库连年空虚，但对于整个王朝的稳定起到了至关重要的作用。
首先是蒙古的察哈尔部、科尔沁部、插汉部全部归顺明朝，女真部落迁徙到鸭绿江一带，整个关外成为汉人的领地，在朝廷的推动下正式开始开发这片肥沃的土地，假以时日将成为重要的粮食产区。其次这三场战争成功的转移了推行新政引发的内部矛盾，使得土地重新回到佃农手中，解决了土地兼并导致农民起义的恶性循环。
此时朱由校才真正的将濒临崩盘的大明王朝拉到正轨上来，中华民族强大的造血能力让这片土地再次焕发出勃勃生机，这就为他下一步解决西域问题提供了充足的经济条件。
历史上这里曾经有九姓铁勒，唐朝天宝三年，骨力裴罗在唐军的支持下推翻了突厥人的暴政，建立了回纥汗国，疆域覆盖贝加尔湖以南，阿尔泰山以东，阴山以北和兴安岭以西的整个蒙古草原。同年唐玄宗封骨力裴罗为怀仁可汗，回纥汗国成为唐帝国的藩属，并改名为回鹘。
随着唐帝国的轰然倒下，后续的中原王朝基本放弃了这片相对贫瘠的土地，这里成为各游牧民族争夺的势力范围。十二世纪初部分契丹人在耶律大石的率领下，先后征服了喀拉汗王朝和高昌回鹘王国，建立了西辽政权。蒙古兴起以后，回鹘人起兵反抗西辽的压迫，归顺成吉思汗，成为后来察哈台汗国的领地。
明朝建国后，往西到达哈密一带，在这里设置了哈密卫作为明帝国的西垂。此时由于蒙古分裂为鞑靼、瓦剌，无力管辖东起哈密、南至和田的广大回鹘地区，经过二百多年的分散割据，逐步形成统一的喀什噶尔汗国，因都城为叶尔羌，史学家们又称之为叶尔羌汗国，统治者仍为察哈台的后裔。
在元明两朝，这支族群一直被称之为畏兀儿，大家基本相安无事，保持了近三百年的朝贡关系。清朝的官方文献中将他们称为“缠回”等，这多少有些不雅。在清末时，该族的一位汉文名为郝登榜（维吾尔文名努日伯克）的秀才，将名词改为“威武尔”。虽然郝登榜对自己的民族非常自豪，但“威武尔”过于刚猛，容易影响民族团结，于是到了1934年，时任民国教育部长的徐廉将其换成维吾尔，意为维护（维）我们（吾）和你们（尔），并一直沿用至今。
言归正传，此时西域有准格尔、布哈拉和叶尔羌
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