因为一些特殊原因并没有携带肉体，而是以灵体的形式在这世间游荡。
一次偶然的机会，两人相遇，从此以后便开始了"同居生活"。
"乔恩先生"什么都好，就是太喜欢开玩笑了，总会说一些让人相当无语的话，个人素质也有待提高……
言归正传。
经过长时间的驾驶，两人来到一处基地前。
――特务机关nerv，隶属于联合国的秘密组织。
闸门关闭。
头顶的红光将真嗣的脸照成一片血红，他有些不安地问道：「我爸爸真的就在这里吗？」
葛城美里说：「没错。」
顿了顿，又道：「对了，你知道你父亲在做什么工作吗？」
真嗣顿时沉默。
好半天才说道：「老师说，爸爸的工作是守护人类，是一份非常重要的工作。」
同一时间，会议室。
「经过讨论决定，我们将本次作战的指挥权全部交给你。」
「让我们看看你的本事吧。」
一个墨镜胡子男，乍看上去和madao似的，淡然地说：「明白了。」
上首处。
三个军方***痛心疾首地说：「经过之前那次作战，我承认我们现在所持有的武器对目标来说毫无威胁。
但你，真的有把握战胜他吗？战胜那种非常理的存在。」
胡子男推了下眼镜，自信满满道：「nerv就是为此而存在的，就让我们拭目以待吧。」
语落，高台降下。
会议室中又恢复了寂静。
唯有冰冷的电子音在耳边播报。
【目前为止，目标依旧没有任何变化，现在迎击系统的运作率是7.5%。】
稍远的位置，白发男人背着手说道：「联合***那边也束手无策了，你要怎么做？」
胡子男碇源堂言简意赅：「启动初号机。」
「初号机？可我们没有驾驶员啊。」
「没问题，另一个替补人员很快就送到了。」碇源堂的表情明灭不定，语气中略显复杂。
回到车内――
补完妆的葛城美里面对真嗣道：「接下来……」
「要去爸爸那边。」真嗣抢答。
与此同时，脑海中不禁回想起许多画面。
悲惨的画面；
孤独的画面。
就在这时，乔恩
…。。