复兴希望也破灭了。
此后3年，毛利家东击尼子，西战九州大友，虽然是两线作战，但强弱胜负之势却全然不同了。最终，在足利义辉的调解下，与大友和睦，为隆元子幸鹤丸和大友义镇女商定婚事。隆元更获得幕府赏赐备中、备后、周防、长门四国守护职。
停止了西方战事的元就，倾全力向东，连下数城，最后团团围住尼子居城月山富田。这场围城战打了相当长的时间，直到尼子义久中了反间计，杀死老臣宇山久幸父子，导致军心混乱，局势才一发不可收拾。1566年11月，义久兄弟出城降伏，即被送往安艺高田郡圆明寺幽闭起来。
毛利元就虽然接见了朝廷的使者，但是对于进入京畿一事并没有答应，尼子家还在负隅顽抗，毛利元就觉得只有彻底灭亡尼子家才能放心。
但是对于称霸京畿，夺取了征夷大将军之位的岛津忠直也是不满，他虽然不会出兵，但还是告诉使者，等他解决了尼子家就会上洛。
好在没有毛利家参与，岛津忠直面对的敌人并不是很强大，他让浅野忠广与津田守信兄弟率领六千人与田山高政筑城防守石山本愿寺的大军。
新筑的山城内有大量的火器，城头上数十门大筒，以及几门国崩，还有数百挺铁炮。
城内兵马两万，囤积的粮草可以坚持半年，这些物资都是界港的商人送来的，当然界港的商人也不是那么好心，这都是花了钱的，只不过价格便宜一些。
山城外的敌军是五万一向一揆大军以及两万三好大军，他们号称十万，但是面对如龟壳一般的山城也是束手无策，多次进攻都败退而回，三好义继和显如上人也没了继续强攻的心思。
不过他们在了解了城内的火器后，便派人前往界港以及根来寺购买大筒，与城内的岛津军对轰，但是在国崩的炮轰下，败下阵来。