德二十一年秋，随着北方彻底的平定，黄琼突然下密旨给驻扎在大理的齐军，废掉大理国王段素平。将其除了王太子一系之外，其余的王宗与眷属全部押解进京。在密旨上黄琼给驻大理国的将领，要求大理国王宗不能死一人，不能逃一人。无论男丁女丁，一律全部押解进京。但在路上要做到，即要严加看管，又要礼貌有加。不允许出现任何侮辱大理国王事情。
并废除大理国以及大理国王位，改为册立其长子段素隆，为云南总管、镇南郡王。负责管理当地的诸部族事务，只能有不超过五千的族军。在原大理国设置云南路，设立安抚使、节度使等中原诸官。并册封当地的摆夷大族，以及滇东三十七部诸部头人与首领，为世袭官职。分别册封为参议、同知、团练使、宣慰使等世职。并制定了，极其严格的考核与奖惩制度。
甚至规定，其继承人必须得到朝廷认可，而且要到国子监读书五年，才允许回去继承世袭职务。而且鼓励，其子弟分家另过。以土官治理本部族百姓，以流官治理汉人百姓。并在大理国故地，分别设置丽江府、鹤庆府、楚雄府、武定府、曲靖府、大理府，改鄯阐府为昆明府、腾冲府，共计八府，并永宁、广南、孟定、新化、瑞丽、镇康、徽江、威远等八直隶州。
以及部族众多之地，设立军民事务一体的建水、陇川、孟艮、车里四厅。并将原大理国所属东南一部分，主要是滇东三十七部聚居区，设立广南府并划归广南西路。同时，对原来大理国几大世家所属百姓，改为流官治理。如此一改原本大齐定制的，一路设置府不得超过十个的定制，原因还是大理国部族太多，汉人太少。