福建路已经彻底平定。叛军最后一个堡垒漳州府城，已经彻底的收复。生俘福建路叛军首领，并以下各级将领，以及附逆的文官七十八人，士兵两万三千人。其中俘获的将领与文官，已经派人押解进京。连同缴获粮食二十万石，银钱共计一百三十五贯，金银各两千两，布帛两万七千匹。
看着杨继元的奏报，黄琼彻底的松了一口气。福建路那边解决完毕，也就意味着此次蔓延了四年，波及了除了两川与黔中路之外，几乎整个江南的叛乱已经彻底平息。一直叛乱牵绊的自己，终于可以放手做其他的事情了。想到这里，黄琼提笔在杨继元的奏折上，直接批了朕心甚慰四个大字。同时让他利用缴获的钱粮，安抚当地流离失所的百姓。
让杨继元暂时署理福建节度使，除了清缴散兵游勇之外，立即着手恢复福建路。由杨继元统帅的诸军，除了留一部重新组建福建路卫军之外，其余的调往两浙。以这些军马为根底，重组两浙卫军。此外，黄琼还让杨继元将有功将士名单，抓紧时间呈上来。用黄琼的话来说，该赏的要赏，要晋级的要晋级。福建路官员，朝廷会在最短时日之内给他补齐。
批复了杨继元的折子之后，黄琼又命人将傅远山与吕端，吏部尚书都招了过来。命他们立即拿出一个名单，将福建路官员尽快的补齐。此次叛乱，福建路与广南东西二路一样，官员损失最为惨重。地方官员或是附逆，或是被杀，或是自尽的。剩下的，也都跑到了两浙，当地几乎是十不存三四。善后这活，还是得文官，武官做这种事情差的太多。