西域的战事结束之后，便需要建设和恢复，还有分配各方的利益。
孙可望将希瓦汗国的牧场，分给了小玉兹，而小玉兹则在乌拉尔河流域，划出大块的牧场，让给准格尔部修养生息，做为防御罗刹的前哨。
伏尔加河畔游牧的数万土尔扈特部蒙古，则被迁到天山北麓，准格尔盆地西面的夷播海（巴尔喀什湖和伊犁河）附近，阻止罗刹人从北面南下，同时也防备还没有臣服于金国的辉特蒙古。
在利益分配之后，孙可望将安西王府，从闭塞的莎车迁至龟兹，西域都护府也设此处，并向长安上奏章，请求迁徒一千富户到龟兹，以便于龟兹能迅速成长为一座重城。
除此之外，孙可望请设安西四镇，设安西四将军，并为四将讨要一定的便宜之权。
因为西域不比汉地，四周都是异族，所以军事政事，都得由镇将说的算，并给予他们一定的特权，不能像对关中的军队和将领一样限制他们。
这四镇，孙可望也已经想好，于昆仑山北麓的于阗设一镇，命一人为总兵官，防备乌斯藏;于河西走廊的出口哈密设一镇，保证西域与关中的联系;于天山北麓故唐北庭都护府旧址，重建庭州，设一镇控制准格尔盆地，方便与蒙古贸易;于热海之西，俱兰城之东，重建碎叶城，设一镇控制三部玉兹和准格尔部。
如果这四镇能够建立起来，那金国对于西域的控制，就不是名义的控制，而是确确实实的建立起了一套军事和行政体系来控制西域和中亚地区。
与此同时，对于臣服的部落和藩国，孙可望也做出了一些规定，并达成一些共识。
这其中最关键的一条，也是符合所有人利益的一条，就是保护丝路。
丝绸之路漫长，金国没有实力保护，所以孙可望将丝路划分成几段，每个藩属或是贸易同盟境内各一段，税率根据道路的长短等因数来规定，收多少税需要由安西都督府和各国商议之后，该段丝路的控制国才能收税。
每一段丝绸之路，安西都督府只给一家征税的权力，但这一家征税之后，便有义务来维持丝绸之路的通畅，打击沿途的盗匪。
如果不能胜任，则由安西都督府出兵帮助解决，但出兵的费用和粮草，须要从该段丝绸之路的关税上扣去。
这样一来，各藩属和贸易联盟国，为了保存能够收取关税，便只能尽力维护商路的通畅。
之前，金国的货物，从关中到西域，再到中亚经过撒马尔罕入莫卧儿北部，因为沿途部
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