回到京师之后，司马珂便向司马衍提出辞让都督中央军事一职。不再统领王室六军、五营校尉和城外诸军。
对于司马珂来说，王室六军和五营校尉都是世兵，大多数军士都只是把当兵作为一个饭碗，并没有多少战斗力和士气。虽然经过两年的训练，战斗力略有上升，但是依旧积重难返。
最重要的是，如今他都督六州军事，马上要接手京口之兵，如果不交出中央军事，难免会让人浮想联翩，引发各种猜测。对他来说，掌管好各兵镇之兵，为将来的西征和北伐做好准备，才是头等大事。中央军此时反而成了烫山芋，今早丢掉为好。
司马衍自然也明白这个道理，两次拒绝了司马珂的奏请之后，在司马珂的再三坚持之下，终究是同意了。
王室六军，关系到皇宫的安危，所以中护军一职司马衍还是执意要由宗室统领，便由车骑将军司马冲所兼领。
由于中领军纪睦被司马珂调到了荆州，中领军空缺，改由右卫将军褚裒所担任。城外守军依旧由周谟所领。
而天策军和羽林骑，均为司马珂所建，司马珂请将此两军移镇京口，以做将来北伐之兵，亦得到了司马衍的同意。
在司马珂解除都督中央军事之职后，便立即让郗鉴在京口买了一处宅子，作为府邸。同时天策军和羽林骑也分别告别了原来的乐游苑和南苑大营，由郗鉴在京口另辟一处大营作为两军所用。
自司马珂移镇京口之后没多久，郗鉴便奏请朝廷乞骸骨，请辞太尉之职，解都督中外军事，解都督都督晋陵郡、吴郡诸军事。虽然这一切都在计划之中，但是司马衍只批准了郗鉴请辞之职，但是并未批准其乞骸骨，而是改拜郗鉴为太傅，目的是让郗鉴风光的到七十岁再致仕。太傅之职不常设，更在三公之上，称为上公，也算是极尽荣耀。
郗鉴推让再三，最终接受太傅之职。为了投桃报李，郗鉴走得也极其干脆利落，彰显其高风亮节。
郗鉴走时，辟原太尉府长史刘遐为太傅府长史，荐举北中郎将李闳为右卫将军，荐举自己的侄子郗迈为尚书郎，两个儿子则为太傅府掾属，同时辟王羲之也为太傅府掾属，一家人齐聚建康，也算是其乐融融。
这样一来，几个对司马珂不是很感冒的主要将领全部被郗鉴带入京师，只留下对司马珂印象极佳的督护夏侯长，来协助司马珂顺利接手京口之兵。郗鉴此举，既为司马珂扫清了接手京口的障碍，同时也算是对李闳、刘遐和郗鉴的子侄们的一种保护。
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