当然长安守军也毫不示弱，各式城防武器不惜血本地向方貌大军倾泄着弹药，而且又是凭城而战居高临下，占了射程的优势，在与方貌军的对轰之中，竟是大占便宜，炸毁方貌军各类攻城器械无数。
方貌大军接连猛攻长安城十余日，期间更是数次派出步兵强行登城，但均是无功而返，且士卒伤亡极重，而长安南北两面的火神山赤羽军与玄武湖搏浪军，正在史文恭和韩世忠率领下向方貌军的两翼发起猛攻，意图增援长安。
而就在双方僵持不下之际，忽一日，公孙胜却在长安城头之上筑起法坛，登坛作起法来。
却见只公孙胜念过三遍法咒之后，长安城的上空就立即风云变色，电闪雷鸣，只在顷刻之间便狂风大起，飞沙走石，骤雨冰雹倾泻而下，更有一道闪电直击在方貌的帅旗之上，竟将帅旗生生劈断，方貌军心立时为之动摇。
连日攻城不克，帅旗又折，军心不稳，方貌军现在的压力也是越来越大，再过几日，又传来梁军大将张宪、朱武正率领萧关与潼关的两处援军正向长安赶来的消息。
方腊军领军大将方貌此时已知再无攻克长安的可能，而且等各路梁军援兵一到，反倒会陷入梁军的包围之中，甚至会有全军覆没之忧。
方貌见事不可为，便立即决定撤军，但卢俊义又岂会让他从容退走，当即传令全军出击，追歼方貌大军，由此，林冲、韩世忠、史文恭、张宪、朱武等五路大军，便开始在关中大地四处围剿方貌。
方貌攻不下长安，与前来围剿的各路梁军交战又连战连败，便想要退回汉中，但通往汉中的各处关卡却又都有梁军重兵把守，方貌屡次冲关均是以失败告终，不得已之下只能如丧家之犬一般，在关中四处逃窜。
而进驻汉中的方天定，此时也得知了方貌兵败长安的消息，便自汉中和渝州两地出兵，猛攻关中南部各关，但都被狄雷、曹宁所阻，只能是望关兴叹，无可奈何。
同时坐镇江南的方腊也知方貌被困关中，便派邓元觉、石宝、庞万春率领三路大军横渡长江北上，攻击淮南、庐州、荆湖三地，意图吸引梁军分兵，为方貌减轻压力，好让方貌趁机脱困出关。
但卢俊义也早有对策，传令董平、杨再兴、岳翻三镇兵马齐出，迎战方腊的三路大军，三处战场在长江沿线一字排开，双方鏖战数月之久，虽是互有胜败，但方腊的三路大军也终是半步不得跨过长江。
而被困在关中的方貌，此时却四处碰壁，已是无路可逃，在弹尽粮绝之际，终
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