而此时这些未被收编的官军降卒在梁山上已经住了些时日，也早已瞧到了梁山的好，倒是有大半人不愿意走，便都留在了梁山。
梁山虽是不大，但也是五行八作一应俱全，这些官军降卒或是打鱼种地，或是做工做侍，倒是很快便极其自然地融入了梁山。
而经过重新整编的梁山兵马共有五万余众，便称作绿林梁山军团，由晁盖亲任军团长，王伦任副军团长，军团之下设立四个师以及两个独立旅。
绿林梁山军团第一师为亲卫师，也就是晁盖的直属部队，晁盖自任师长，下辖两个旅及四个团，由绿林总部精锐、归降官军以及原梁山军团部分精锐组成，共计一万人。
其中一旅为骁骑旅，抽调原彭玘所部陌刀军精锐组成，骁骑旅日常行军皆乘马匹，而在作战之时则即可做为骑兵进行马上交锋战，亦可下马组成陌刀阵步下作战，下辖六个营，共三千人，由彭玘任旅长。
二旅为金枪旅，由大破铁甲连环马的钩镰枪手、挠钩手、捆绑手组成，下辖六个营，共三千人，由徐宁任旅长。
亲卫师一团是晁盖的侍卫团，由绿林总部精锐组成，刘唐任团长；二团为刀盾团，由芒砀山绿林人马组成，项充任团长；三团为枪盾团，由芒砀山绿林人马组成，李兖任团长；四团为斥候团，由原梁山军团先锋营扩充组成，薛永任团长；亲卫师四个团各下辖十个连一千人。
梁山军团第二师为全员骑兵师，由新近上山的呼延灼任师长，下辖两个旅及四个团，由归降官军骑兵以及梁山、绿林原有骑兵组成，共计一万人。
第二师一旅为铁甲连环旅，既原呼延灼所部的铁甲连环马军，下辖六个营，共三千人，由呼延灼代任旅长；二旅为前锋旅，即原韩涛所部轻骑以及部分归降官军骑兵，下辖六个营，共三千人，由韩涛任旅长。
第二师一团为玄甲重骑团，由原梁山军团具装重骑营扩充组成，邹渊任团长；二团为陷阵重骑团，由原梁山军团普装重骑营扩充组成，邹润任团长；三团为轻骑团，由原梁山军团轻骑营扩充组成，吕方任团长；四团为弓骑团，由原梁山军团弓骑营扩充组成，郭盛任团长；四个团各下辖十个连一千人。
梁山军团第三师为水战师，也暂由晁盖代任师长，下辖三个旅，抽调原梁山水军、石碣村渔户以及绿林水师组成，总兵力一万人。
水战师分别于梁山水泊的东、西、北三处设下水寨，由阮氏三雄分任旅长，一旅驻扎水泊正北鸭嘴滩水寨，下辖八个营，共四千人，
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