奈欧斯篇幅很短。
总共十二集，和《赛文X》差不多，同样是两周内完结。
但两者完全不同……
《赛文X》的结局，好歹有7爷与安奴发糖吃，而奈欧斯的结局，全是刀子。
黑暗物质，已经侵蚀了地球所有人，凝聚出巨大化的恶魔怪兽，将人类控制为傀儡。
元气最后一次变身！
他败了，他没能拯救世界，能量耗尽倒在了城市中，黯淡无光的双眼与彩色计时器，与身旁的“万家灯火”形成了鲜明对比。
直到那个小男孩出现！
那是第一集里，牵着狗狗的男孩。他是第一个相信奈欧斯的人，也是最后一个。
当人们为“恶魔”打倒奥特曼而欢呼时，他是唯一一个，戴着奥特曼面具，给奈欧斯加油的人。
然而他也败了……
面具被人踩碎，奥特曼倒地不起，所有人都不相信，奥特曼是在为正义而战。
他为什么保持清醒？
答案很简单，他相信“福满多”。福满多是那只柴犬，它让小主人摆脱了黑暗物质的侵袭，一直相信奥特曼。
所以，他哭了。
他走到奥特曼身边，用小手戳了戳奥特曼，又爬到奥特曼胸口，枕着他的计时器，流下了赤子之泪。
奇迹发生了！
孩子的眼泪，唤醒了奈欧斯，他的计时器重新亮起光芒，用手捧起那个孩子。
重重地点了点头。
奈欧斯再一次出击，这次他获得了更强大的力量，历经千辛万苦终于击败了恶魔怪兽，消除了最后的黑暗物质。
人类重获新生！
摆脱黑暗物质影响的同时，他们也失去了这段时间的记忆。
因此，无人记得城市中那个高大的巨人，竟然是拯救他们的恩人。
除了那个小男孩……
夕阳下，元气与小男孩拉钩，约定要做一辈子的好朋友。然后变身奈欧斯飞出地球，与佐菲、赛文21汇合。
他最后回头看了一眼！
地球上，人们各自忙活着自己的事，虽然不知道发生了什么，但每个人都露出了“劫后余生”的幸福微笑。
小男孩与柴犬站在山岗上，向天空用力挥手，大喊道：“再见了，奈欧斯！”
再见了，奥特曼！
【全剧终】
伴随着一阵悠扬婉转的手风琴声，奈欧斯的故事至
…。。