面的一排巨大的工棚之中，这里是工程指挥部所在，四周的墙壁上挂满了木牌，上面写着严格的施工管理制度和安全规范，上到项目主管，下到刑徒奴隶，所有人都要严格按照规章制度行事，凡是违反规定者都会被惩戒甚至被驱逐。
因为图书馆和京师大学工程筹集了足够的钱款，因此在各项安全和后勤保障方几乎面面俱到，而且鉴于这项工程的严肃性和未来的安全性，陈旭没有像东方道一样向民间建筑队进行招商，而是全部由科学院从设计规划到建设施工，以保证这个项目不出问题。
虽然是朝廷立项皇家科学院承建，但在用人和财务管理上，陈旭还是采用了独立核算的公司管理方式，民夫每天两斤粮食外加四钱工钱，每月结算一次，刑徒和奴隶每天两斤粮食基本上管饱，而且户部和刑部还会根据工程完成的质量和进度最后予以减刑甚至解除奴籍，因此所有征召而来的人都非常的卖力。
最大的一间挂着工程总指挥的工棚里面，迎面的墙壁上挂着一张巨大的施工图表，上面仔细的罗列了策划的工程进度，什么时候基坑完成，什么时候渣土清理完毕，什么时候地下室完成等等，而在工棚的中央，放着一个巨大的沙盘，精细的制作出来一副整个工程完成之后的效果图。
整个工程规划为一副八卦太极图形，阴阳鱼的两只眼睛位置就是图书馆和大礼堂，一条阴阳双鱼线为中轴，将京师大学分成东西两个校区，分别将图书馆和大礼堂包括在其中，整个规划呈开放格局，四周有亭台楼阁和曲院回廊交织相连，根据八卦方位分别设置了假山、池塘、树林、溪流，充分体现天地人和之势。
图书馆仿照天坛设计，整个建筑呈现圆形格局，但却不是一栋房子，而是仿照蹴鞠广场修建成为一个巨大的环形单体建筑，地基长宽各一百丈，分五层共计抬高十丈，里面连同地下室一起修成五层，最底下两层用来用来存放各种古老而珍贵的孤本古籍，基本不对外开放，只针对特殊研究群体，其余三层同样用来存放金石竹木龟甲骨片等古籍，因为处在抬高的地基之中，所以四周像碉楼一样设计了许多窗户增强采光和通风，这三层的典籍虽然对外开放，但针对的是五大学院还有朝廷署衙等部门，民间人士也可以进入查阅资料，但是需要申请获得许可，地上建筑部分直径六十丈修建成为三层，布置成为开放式的图书馆，用来存放并不算珍贵的竹木简牍和出版社印刷出来的书籍和报纸等等。
整个图书馆占地三十亩组左右，独立天井格局，全部采用钢筋混凝土浇筑框架，
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