百里沙、田文居对高峻山提出了尖锐的批评，之后，经过会议一致通过，对部队进行了重新整合：
第一旅，总兵蔡芝山、副总兵贺人龙，辖五营一万八千人；
第二旅，总兵曹文诏、副总兵白文选，辖五营一万八千人；
第三旅，总兵红军友，副总兵曹变蛟、马进忠、惠登相，辖十八营，三万五千人；
直属营，总兵李部司，辖“周世臣”营、“江国荣”营、“刘达”营，一万人；
水军营，水军都督周文江，水军督导潘独鳌，三百人。
这次调整部队，是因为在卢氏和邓州战损近半，高峻山不得不对部队进行一次精简，把五个旅缩编为三个旅。
第一旅主要的任务是保卫老营，所以必须是由蔡芝山担任主帅。第二旅是主力旅，交给曹文诏那是理所当然的。余下的几家杂牌就集中在了第三旅，这样便于统一管理。
高峻山把队伍拉到桐柏山修生养息，将第三旅一分为四，红军友、曹变蛟、马进忠、惠登相各率一部，分散在桐柏山外围的山口要道，与明廷的官军开展山地游击战，官军来了就隐藏于山谷之中，官军走了，又出没于乡村小镇。
在桐柏的这段日子里，高峻山为养子马金举办了一个隆重的婚礼，娶的是应城县令张绍登的女儿——张子婷。
不用说，媒人自然是他的三位夫人，特别是大夫人韩雨烟，好像跟张子婷有缘似的，两人一见面，话就一大筐，说也说不完，一来二去的，韩雨烟就把张子婷收为了干儿媳。
把张子婷娶进门，最高兴的莫过于马金，他喜欢张子婷，喜欢的不得了。马文和刘文秀也是高兴，因为他们为有这么个美貌如花的嫂子而高兴。
婚礼的这一天，张绍登夫妇也来到桐柏山，他们为女儿的美好姻缘而祝福。
张绍登还带来了张献忠的消息，张献忠现在就在襄阳西北的郧襄山区一带活动，高峻山听到这个消息，连忙派孙可望前去与张献忠联络，约定如有重大的军事行动，相互协调一致，共同对敌。
崇祯十年的整个夏天，高峻山都在桐柏山区，因为夏季天气炎热，且常有暴雨，不利于行军打仗，加上高温天气，士兵容易染病，所以高峻山决定待到秋高气爽、兵强马壮之时，再出山与官军作战。
在桐柏休整阶段，高峻山又开始忙于崇文书院的教学工作，同时关注起孙元化的火药研究的进展情况，由于连连征战，没有一个稳定的基地，孙元化的研究进展缓慢，
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