起家为著作佐郎，累迁尚书吏部郎，掌典选，进达有方，性平和，不抑寒素，补吴兴太守，有德政。
女儿成为皇后，迁光禄大夫，领五兵尚书、本州大中正，册封建昌县侯，辞让不受。
改授都督京口诸军事、左将军、徐州刺史、假节，再次辞让。谢安以褚裒故事劝说他，接受任命，镇于京口。
不久征拜尚书左仆射，将军如故，迁丹阳尹，即本军号加散骑常侍，王蕴因为自己是外戚，不想在朝内，一再请求外任，出任都督浙江东五郡、镇军将军、会稽内史，常侍如故。
嗜酒，晚年尤为严重。在会稽内史任上时，常终日不醒。但为政和简，为百姓所悦。
知人，有识鉴，次子王恭与王忱交好，王蕴看出二人个性不合，交情不会维持始终，后来，王恭与王忱果然反目。
太元九年去世，时年五十五岁，追赠左光禄大夫、开府仪同三司。