朱由检正式下了诏书，任命孙传庭为辽东巡抚，节制山海关外所有兵马。
在任命诏书下的第二天，孙承宗便递交辞呈，要辞去兵部尚书之位告老还乡。苦心设计的辽西经营策略被否定，让孙承宗非常难受，感觉没脸再当这个兵部尚书。
朱由检便召其进宫，进行劝慰。
“并非朕不欲进取，实在是辽西牵扯了朝廷太多精力，以至于忽略了其他，”朱由检指着地图上蓟北的位置，“孙师请看，这蓟州千余里边墙，自万历年以来几乎没有进行过修缮，几十处山口可以轻松出入，若是建奴绕道草原从蓟北来攻怎么办？故朕决定把辽西钱粮分出一部分经营蓟北。”
孙承宗看着蓟北地图，皱眉道：“可是蓟州边墙以外是蒙古地盘，距离建奴所居辽沈有重山相隔，路途多达数千里。”
朱由检叹道：“孙师为兵部尚书，应该知道蒙古林丹汗已经被建奴击败西迁，而建奴旗丁几乎人人会骑马，几千里路途又算得了什么？一旦建奴真的选择从蓟北入侵，孙师您想过会有什么后果吗？”
孙承宗默然，后果是什么显而易见，建奴必将长驱直入，甚至会一直打到北京城下，到时必然天下震动。虽然他仍然不认为建奴会这样做，可是万一呢，万一建奴真的这样做，那么几百里辽西防线将会成为笑话。
“蓟北和辽西犹如大明两个门户，失其任何一个，都将危及京师，故朕不能把所有钱粮都耗在辽西。在辽西修堡垒何如把钱用在修缮蓟北防线？”朱由检淡淡道。
孙承宗长叹一声：“陛下说的对，是臣错了......”
朱由检抚慰道：“朕知道孙师您也是一心为国，并无私心。若非孙师，辽西早就糜烂不堪，哪有如今局面。”
孙承宗摇了摇头，惭愧道：“臣只看到了辽西一处，没有统观全局，实在汗颜。陛下，这个兵部尚书还是由他人来做吧，臣愿往蓟北修缮边墙，替陛下经略蓟镇。”
朱由检叹道：“只是委屈孙师了。”
翌日，朱由检下旨，加封孙承宗为太子太保，并赏赐蟒袍、玉带、银币，挂兵部尚书衔督师蓟北，统管蓟州，宣大，山海关一应军事！以赵率教为山海关总兵，以满桂为蓟镇总兵，皆听孙承宗调遣。
这意味着把边事分为两部，山海关以内，由孙承宗负责，山海关以外归孙传庭这个辽东巡抚管辖。
孙承宗资格老经验足，又善于修筑城堡，由他负责，蓟镇边墙防线应该很快能修缮好，即便不如辽西
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