巫妖残部，遵道祖之命，各自退守。巫族几位幸存祖巫，带着残存的族人，回归不周山遗址附近的祖地，依托残留的父神气息与大地浊气，建立结界，永镇地脉，极少出世。妖族则更为分散，部分血脉高贵、实力强横的大妖，隐于名山大川，自成一方势力；部分则接受天庭招安（或被迫），成为星神、山神、河伯等，归入天庭体系；更多的底层妖族，则散落山林，与人族及其他种族杂居，开始了新的生存竞争。
西方教，在接引、准提的带领下，趁巫妖衰败、天庭初创、百废待兴之际，加紧在西方及部分东方地域传教，吸纳信众，扩张势力。他们倒也暂时遵守道祖之命，未敢明目张胆地扰乱三界秩序，但其教义中隐含的因果束缚与愿力修行之法，依旧吸引了许多迷茫困苦的生灵。
岁月流转，自补天、立轮回、重立天庭，已过去数百年。
三十三重天，弥罗天境已初具规模。凌霄宝殿虽不如昔日妖族天庭那般金碧辉煌、煞气腾腾，却更显庄严、肃穆、祥和，与天道相合。瑶池仙境仙气缭绕，蟠桃园内灵根吐蕊，虽未到结果之时，但已显不凡气象。南天门巍峨耸立，有天兵天将（初代多为散修或诸圣门下，修为参差不齐）值守。斩仙台、化仙池等建筑也已建成。
昊天上帝与西王母，经过数百年的苦心经营，加上诸圣派来的门人弟子辅助，终于将天庭的基本框架搭建起来。设立了三官大帝（天、地、水）、四值功曹、五方揭谛、六丁六甲、二十八宿、九曜星官、三十六天罡、七十二地煞等神职，然而许多职位尚且空缺，或由修为较低者暂代，天庭虽立，实则空虚，远未达到后来封神之后那般完备有序之景。 周天星辰在羲和（太阴星君）及部分归顺妖神的协助下，也初步恢复了有序运转。
这一日，凌霄宝殿钟鼓齐鸣，仙乐飘飘。昊天上帝与西王母，正式于弥罗宫凌霄殿，接受诸圣（化身或代表）朝贺，宣告天庭正式运转，统御三界。
付一笑（太清圣人）、女娲娘娘、元始天尊、通天教主，皆遣化身或重要门人（如玄都、多宝、广成子等）到场，以示对天庭正统的支持。西方教接引、准提亦遣弟子（药师、弥勒）前来观礼，虽面色疾苦，却也依礼行事。
“自今日起，天庭重立，三界秩序，当由朕与王母，会同诸圣，共维共守！”昊天上帝端坐帝位，声音威严，传遍三界，“望三界众生，各安其位，各司其职，共修道德，同享太平！”
“陛下圣明！王母慈德！”殿内众仙神齐声恭贺，声震寰宇。
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